Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC82Q8N4S0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC82Q8N4S0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC82Q8N4S0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC82Q8N4S0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC82Q8N4S0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC82Q8N4S0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC82Q8N4S0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC82Q8N4S0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC82Q8N4S0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC82Q8N4S0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC82Q8N4S0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC82Q8N4S0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC82Q8N4S0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC82Q8N4S0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC82Q8N4S0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC82Q8N4S0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC82Q8N4S0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC82Q8N4S0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC82Q8N4S0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC82Q8N4S0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC82Q8N4S0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC82Q8N4S0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC82Q8N4S0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC82Q8N4S0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC82Q8N4S0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC82Q8N4S0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC82Q8N4S0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC82Q8N4S0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC82Q8N4S0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC82Q8N4S0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC82Q8N4S0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC82Q8N4S0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC82Q8N4S0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC82Q8N4S0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC82Q8N4S0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC82Q8N4S0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC82Q8N4S0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC82Q8N4S0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC82Q8N4S0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC82Q8N4S0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC82Q8N4S0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC82Q8N4S0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC82Q8N4S0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC82Q8N4S0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC82Q8N4S0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC82Q8N4S0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC82Q8N4S0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC82Q8N4S0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC82Q8N4S0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC82Q8N4S0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC82Q8N4S0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC82Q8N4S0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC82Q8N4S0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC82Q8N4S0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC82Q8N4S0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC82Q8N4S0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC82Q8N4S0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC82Q8N4S0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC82Q8N4S0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC82Q8N4S0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC82Q8N4S0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC82Q8N4S0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC82Q8N4S0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC82Q8N4S0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC82Q8N4S0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC82Q8N4S0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC82Q8N4S0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC82Q8N4S0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC82Q8N4S0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC82Q8N4S0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC82Q8N4S0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC82Q8N4S0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC82Q8N4S0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC82Q8N4S0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC82Q8N4S0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC82Q8N4S0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC82Q8N4S0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC82Q8N4S0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC82Q8N4S0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC82Q8N4S0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC82Q8N4S0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC82Q8N4S0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC82Q8N4S0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC82Q8N4S0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC82Q8N4S0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC82Q8N4S0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC82Q8N4S0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC82Q8N4S0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC82Q8N4S0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC82Q8N4S0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC82Q8N4S0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC82Q8N4S0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC82Q8N4S0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC82Q8N4S0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC82Q8N4S0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC82Q8N4S0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC82Q8N4S0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC82Q8N4S0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC82Q8N4S0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms