Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM48Q8IWZ4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM48Q8IWZ4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM48Q8IWZ4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM48Q8IWZ4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM48Q8IWZ4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM48Q8IWZ4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM48Q8IWZ4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM48Q8IWZ4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM48Q8IWZ4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM48Q8IWZ4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM48Q8IWZ4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM48Q8IWZ4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM48Q8IWZ4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM48Q8IWZ4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM48Q8IWZ4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM48Q8IWZ4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM48Q8IWZ4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM48Q8IWZ4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM48Q8IWZ4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM48Q8IWZ4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM48Q8IWZ4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM48Q8IWZ4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM48Q8IWZ4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM48Q8IWZ4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM48Q8IWZ4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM48Q8IWZ4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM48Q8IWZ4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM48Q8IWZ4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM48Q8IWZ4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM48Q8IWZ4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM48Q8IWZ4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM48Q8IWZ4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM48Q8IWZ4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM48Q8IWZ4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM48Q8IWZ4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM48Q8IWZ4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM48Q8IWZ4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM48Q8IWZ4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM48Q8IWZ4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM48Q8IWZ4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM48Q8IWZ4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM48Q8IWZ4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM48Q8IWZ4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM48Q8IWZ4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM48Q8IWZ4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM48Q8IWZ4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM48Q8IWZ4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM48Q8IWZ4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM48Q8IWZ4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM48Q8IWZ4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM48Q8IWZ4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM48Q8IWZ4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM48Q8IWZ4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM48Q8IWZ4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM48Q8IWZ4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM48Q8IWZ4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM48Q8IWZ4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM48Q8IWZ4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM48Q8IWZ4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM48Q8IWZ4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM48Q8IWZ4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM48Q8IWZ4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM48Q8IWZ4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM48Q8IWZ4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM48Q8IWZ4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM48Q8IWZ4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM48Q8IWZ4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM48Q8IWZ4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms