Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW03

SIAH3, Seven in absentia homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH3Q8IW03 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIAH3Q8IW03 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIAH3Q8IW03 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIAH3Q8IW03 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SIAH3Q8IW03 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIAH3Q8IW03 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIAH3Q8IW03 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIAH3Q8IW03 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIAH3Q8IW03 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIAH3Q8IW03 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIAH3Q8IW03 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIAH3Q8IW03 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIAH3Q8IW03 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIAH3Q8IW03 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIAH3Q8IW03 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIAH3Q8IW03 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIAH3Q8IW03 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIAH3Q8IW03 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIAH3Q8IW03 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIAH3Q8IW03 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIAH3Q8IW03 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIAH3Q8IW03 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIAH3Q8IW03 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIAH3Q8IW03 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIAH3Q8IW03 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIAH3Q8IW03 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIAH3Q8IW03 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SIAH3Q8IW03 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIAH3Q8IW03 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIAH3Q8IW03 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIAH3Q8IW03 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIAH3Q8IW03 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIAH3Q8IW03 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIAH3Q8IW03 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIAH3Q8IW03 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIAH3Q8IW03 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIAH3Q8IW03 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIAH3Q8IW03 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIAH3Q8IW03 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIAH3Q8IW03 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIAH3Q8IW03 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIAH3Q8IW03 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIAH3Q8IW03 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIAH3Q8IW03 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIAH3Q8IW03 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIAH3Q8IW03 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIAH3Q8IW03 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIAH3Q8IW03 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIAH3Q8IW03 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIAH3Q8IW03 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIAH3Q8IW03 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIAH3Q8IW03 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIAH3Q8IW03 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIAH3Q8IW03 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIAH3Q8IW03 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIAH3Q8IW03 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIAH3Q8IW03 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIAH3Q8IW03 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIAH3Q8IW03 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIAH3Q8IW03 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIAH3Q8IW03 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SIAH3Q8IW03 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIAH3Q8IW03 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIAH3Q8IW03 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIAH3Q8IW03 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIAH3Q8IW03 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIAH3Q8IW03 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIAH3Q8IW03 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIAH3Q8IW03 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SIAH3Q8IW03 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIAH3Q8IW03 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIAH3Q8IW03 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms