Protein–RNA interactions for Protein: Q86WT6

TRIM69, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM69, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM69Q86WT6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM69Q86WT6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM69Q86WT6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM69Q86WT6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM69Q86WT6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM69Q86WT6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM69Q86WT6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM69Q86WT6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM69Q86WT6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM69Q86WT6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM69Q86WT6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM69Q86WT6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM69Q86WT6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM69Q86WT6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM69Q86WT6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM69Q86WT6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM69Q86WT6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM69Q86WT6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM69Q86WT6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM69Q86WT6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM69Q86WT6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM69Q86WT6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM69Q86WT6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM69Q86WT6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM69Q86WT6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM69Q86WT6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM69Q86WT6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM69Q86WT6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM69Q86WT6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM69Q86WT6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM69Q86WT6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM69Q86WT6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM69Q86WT6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM69Q86WT6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM69Q86WT6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM69Q86WT6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM69Q86WT6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM69Q86WT6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM69Q86WT6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM69Q86WT6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM69Q86WT6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
TRIM69Q86WT6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms