Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR53Q7Z5U6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR53Q7Z5U6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR53Q7Z5U6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR53Q7Z5U6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR53Q7Z5U6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR53Q7Z5U6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR53Q7Z5U6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR53Q7Z5U6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR53Q7Z5U6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR53Q7Z5U6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR53Q7Z5U6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR53Q7Z5U6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR53Q7Z5U6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR53Q7Z5U6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR53Q7Z5U6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR53Q7Z5U6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WDR53Q7Z5U6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WDR53Q7Z5U6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
WDR53Q7Z5U6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
WDR53Q7Z5U6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
WDR53Q7Z5U6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
WDR53Q7Z5U6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WDR53Q7Z5U6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WDR53Q7Z5U6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR53Q7Z5U6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR53Q7Z5U6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR53Q7Z5U6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR53Q7Z5U6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR53Q7Z5U6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR53Q7Z5U6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR53Q7Z5U6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR53Q7Z5U6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR53Q7Z5U6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR53Q7Z5U6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR53Q7Z5U6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR53Q7Z5U6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR53Q7Z5U6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR53Q7Z5U6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR53Q7Z5U6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
WDR53Q7Z5U6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR53Q7Z5U6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR53Q7Z5U6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR53Q7Z5U6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR53Q7Z5U6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR53Q7Z5U6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR53Q7Z5U6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR53Q7Z5U6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR53Q7Z5U6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR53Q7Z5U6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR53Q7Z5U6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR53Q7Z5U6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR53Q7Z5U6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR53Q7Z5U6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR53Q7Z5U6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR53Q7Z5U6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR53Q7Z5U6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR53Q7Z5U6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR53Q7Z5U6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR53Q7Z5U6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR53Q7Z5U6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR53Q7Z5U6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR53Q7Z5U6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
WDR53Q7Z5U6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
WDR53Q7Z5U6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
WDR53Q7Z5U6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
WDR53Q7Z5U6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
WDR53Q7Z5U6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms