Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTU2

EP400NL, EP400 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400NLQ6ZTU2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
EP400NLQ6ZTU2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EP400NLQ6ZTU2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EP400NLQ6ZTU2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EP400NLQ6ZTU2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EP400NLQ6ZTU2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EP400NLQ6ZTU2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
EP400NLQ6ZTU2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EP400NLQ6ZTU2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EP400NLQ6ZTU2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EP400NLQ6ZTU2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EP400NLQ6ZTU2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EP400NLQ6ZTU2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EP400NLQ6ZTU2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
EP400NLQ6ZTU2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.3 ms