Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMD2

SPNS3, Protein spinster homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3Q6ZMD2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPNS3Q6ZMD2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPNS3Q6ZMD2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPNS3Q6ZMD2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPNS3Q6ZMD2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPNS3Q6ZMD2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPNS3Q6ZMD2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPNS3Q6ZMD2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPNS3Q6ZMD2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPNS3Q6ZMD2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPNS3Q6ZMD2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPNS3Q6ZMD2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPNS3Q6ZMD2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPNS3Q6ZMD2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPNS3Q6ZMD2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPNS3Q6ZMD2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPNS3Q6ZMD2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPNS3Q6ZMD2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPNS3Q6ZMD2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPNS3Q6ZMD2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPNS3Q6ZMD2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPNS3Q6ZMD2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPNS3Q6ZMD2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPNS3Q6ZMD2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPNS3Q6ZMD2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPNS3Q6ZMD2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPNS3Q6ZMD2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPNS3Q6ZMD2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPNS3Q6ZMD2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPNS3Q6ZMD2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPNS3Q6ZMD2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPNS3Q6ZMD2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPNS3Q6ZMD2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPNS3Q6ZMD2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPNS3Q6ZMD2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPNS3Q6ZMD2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPNS3Q6ZMD2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPNS3Q6ZMD2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPNS3Q6ZMD2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPNS3Q6ZMD2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPNS3Q6ZMD2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPNS3Q6ZMD2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPNS3Q6ZMD2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPNS3Q6ZMD2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPNS3Q6ZMD2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPNS3Q6ZMD2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPNS3Q6ZMD2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SPNS3Q6ZMD2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPNS3Q6ZMD2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPNS3Q6ZMD2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPNS3Q6ZMD2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPNS3Q6ZMD2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPNS3Q6ZMD2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPNS3Q6ZMD2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPNS3Q6ZMD2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPNS3Q6ZMD2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPNS3Q6ZMD2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPNS3Q6ZMD2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPNS3Q6ZMD2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPNS3Q6ZMD2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPNS3Q6ZMD2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPNS3Q6ZMD2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPNS3Q6ZMD2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPNS3Q6ZMD2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPNS3Q6ZMD2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPNS3Q6ZMD2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPNS3Q6ZMD2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPNS3Q6ZMD2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPNS3Q6ZMD2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms