Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB35

MTHFD1L, Monofunctional C1-tetrahydrofolate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1LQ6UB35 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MTHFD1LQ6UB35 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MTHFD1LQ6UB35 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MTHFD1LQ6UB35 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MTHFD1LQ6UB35 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MTHFD1LQ6UB35 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MTHFD1LQ6UB35 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MTHFD1LQ6UB35 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MTHFD1LQ6UB35 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MTHFD1LQ6UB35 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MTHFD1LQ6UB35 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MTHFD1LQ6UB35 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MTHFD1LQ6UB35 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MTHFD1LQ6UB35 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
MTHFD1LQ6UB35 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MTHFD1LQ6UB35 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MTHFD1LQ6UB35 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MTHFD1LQ6UB35 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MTHFD1LQ6UB35 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MTHFD1LQ6UB35 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MTHFD1LQ6UB35 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MTHFD1LQ6UB35 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MTHFD1LQ6UB35 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MTHFD1LQ6UB35 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MTHFD1LQ6UB35 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MTHFD1LQ6UB35 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
MTHFD1LQ6UB35 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTHFD1LQ6UB35 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTHFD1LQ6UB35 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTHFD1LQ6UB35 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTHFD1LQ6UB35 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTHFD1LQ6UB35 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTHFD1LQ6UB35 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTHFD1LQ6UB35 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MTHFD1LQ6UB35 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MTHFD1LQ6UB35 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MTHFD1LQ6UB35 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MTHFD1LQ6UB35 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MTHFD1LQ6UB35 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MTHFD1LQ6UB35 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
MTHFD1LQ6UB35 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTHFD1LQ6UB35 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTHFD1LQ6UB35 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MTHFD1LQ6UB35 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTHFD1LQ6UB35 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTHFD1LQ6UB35 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTHFD1LQ6UB35 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTHFD1LQ6UB35 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTHFD1LQ6UB35 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTHFD1LQ6UB35 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTHFD1LQ6UB35 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTHFD1LQ6UB35 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTHFD1LQ6UB35 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTHFD1LQ6UB35 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTHFD1LQ6UB35 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTHFD1LQ6UB35 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTHFD1LQ6UB35 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTHFD1LQ6UB35 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTHFD1LQ6UB35 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFD1LQ6UB35 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFD1LQ6UB35 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFD1LQ6UB35 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFD1LQ6UB35 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFD1LQ6UB35 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFD1LQ6UB35 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTHFD1LQ6UB35 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTHFD1LQ6UB35 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTHFD1LQ6UB35 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MTHFD1LQ6UB35 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MTHFD1LQ6UB35 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MTHFD1LQ6UB35 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTHFD1LQ6UB35 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTHFD1LQ6UB35 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTHFD1LQ6UB35 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTHFD1LQ6UB35 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTHFD1LQ6UB35 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTHFD1LQ6UB35 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTHFD1LQ6UB35 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTHFD1LQ6UB35 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTHFD1LQ6UB35 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTHFD1LQ6UB35 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTHFD1LQ6UB35 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTHFD1LQ6UB35 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTHFD1LQ6UB35 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTHFD1LQ6UB35 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTHFD1LQ6UB35 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTHFD1LQ6UB35 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTHFD1LQ6UB35 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MTHFD1LQ6UB35 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTHFD1LQ6UB35 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTHFD1LQ6UB35 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
MTHFD1LQ6UB35 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTHFD1LQ6UB35 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTHFD1LQ6UB35 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTHFD1LQ6UB35 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTHFD1LQ6UB35 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTHFD1LQ6UB35 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTHFD1LQ6UB35 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTHFD1LQ6UB35 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTHFD1LQ6UB35 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms