Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRAMD4Q6IC98 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRAMD4Q6IC98 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRAMD4Q6IC98 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRAMD4Q6IC98 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRAMD4Q6IC98 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRAMD4Q6IC98 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRAMD4Q6IC98 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRAMD4Q6IC98 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRAMD4Q6IC98 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRAMD4Q6IC98 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRAMD4Q6IC98 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRAMD4Q6IC98 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRAMD4Q6IC98 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRAMD4Q6IC98 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRAMD4Q6IC98 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRAMD4Q6IC98 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRAMD4Q6IC98 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRAMD4Q6IC98 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRAMD4Q6IC98 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRAMD4Q6IC98 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRAMD4Q6IC98 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRAMD4Q6IC98 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRAMD4Q6IC98 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRAMD4Q6IC98 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRAMD4Q6IC98 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GRAMD4Q6IC98 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRAMD4Q6IC98 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GRAMD4Q6IC98 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GRAMD4Q6IC98 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRAMD4Q6IC98 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRAMD4Q6IC98 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRAMD4Q6IC98 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRAMD4Q6IC98 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRAMD4Q6IC98 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRAMD4Q6IC98 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRAMD4Q6IC98 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRAMD4Q6IC98 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRAMD4Q6IC98 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRAMD4Q6IC98 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRAMD4Q6IC98 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GRAMD4Q6IC98 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRAMD4Q6IC98 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRAMD4Q6IC98 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRAMD4Q6IC98 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRAMD4Q6IC98 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRAMD4Q6IC98 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRAMD4Q6IC98 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRAMD4Q6IC98 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GRAMD4Q6IC98 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRAMD4Q6IC98 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRAMD4Q6IC98 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRAMD4Q6IC98 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRAMD4Q6IC98 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRAMD4Q6IC98 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRAMD4Q6IC98 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRAMD4Q6IC98 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRAMD4Q6IC98 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRAMD4Q6IC98 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRAMD4Q6IC98 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRAMD4Q6IC98 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRAMD4Q6IC98 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRAMD4Q6IC98 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRAMD4Q6IC98 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRAMD4Q6IC98 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
GRAMD4Q6IC98 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms