Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC30Q5VVM6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC30Q5VVM6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC30Q5VVM6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC30Q5VVM6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC30Q5VVM6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC30Q5VVM6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC30Q5VVM6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC30Q5VVM6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC30Q5VVM6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC30Q5VVM6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CCDC30Q5VVM6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CCDC30Q5VVM6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33■■■□□ 2.87
CCDC30Q5VVM6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC30Q5VVM6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC30Q5VVM6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC30Q5VVM6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC30Q5VVM6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC30Q5VVM6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC30Q5VVM6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC30Q5VVM6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC30Q5VVM6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC30Q5VVM6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC30Q5VVM6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC30Q5VVM6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC30Q5VVM6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC30Q5VVM6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC30Q5VVM6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC30Q5VVM6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC30Q5VVM6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC30Q5VVM6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC30Q5VVM6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC30Q5VVM6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC30Q5VVM6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC30Q5VVM6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC30Q5VVM6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC30Q5VVM6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC30Q5VVM6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC30Q5VVM6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC30Q5VVM6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC30Q5VVM6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC30Q5VVM6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC30Q5VVM6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC30Q5VVM6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC30Q5VVM6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC30Q5VVM6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC30Q5VVM6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC30Q5VVM6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC30Q5VVM6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC30Q5VVM6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC30Q5VVM6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC30Q5VVM6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC30Q5VVM6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC30Q5VVM6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC30Q5VVM6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC30Q5VVM6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC30Q5VVM6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC30Q5VVM6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC30Q5VVM6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC30Q5VVM6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC30Q5VVM6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC30Q5VVM6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC30Q5VVM6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC30Q5VVM6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC30Q5VVM6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC30Q5VVM6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC30Q5VVM6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC30Q5VVM6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC30Q5VVM6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC30Q5VVM6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC30Q5VVM6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC30Q5VVM6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC30Q5VVM6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC30Q5VVM6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC30Q5VVM6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC30Q5VVM6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC30Q5VVM6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CCDC30Q5VVM6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC30Q5VVM6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC30Q5VVM6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC30Q5VVM6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC30Q5VVM6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC30Q5VVM6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC30Q5VVM6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC30Q5VVM6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC30Q5VVM6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC30Q5VVM6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC30Q5VVM6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC30Q5VVM6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC30Q5VVM6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC30Q5VVM6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC30Q5VVM6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC30Q5VVM6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC30Q5VVM6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC30Q5VVM6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC30Q5VVM6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC30Q5VVM6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC30Q5VVM6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC30Q5VVM6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC30Q5VVM6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms