Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRRT3Q5FWE3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRRT3Q5FWE3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRRT3Q5FWE3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRRT3Q5FWE3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRRT3Q5FWE3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRRT3Q5FWE3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRRT3Q5FWE3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRRT3Q5FWE3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRRT3Q5FWE3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRRT3Q5FWE3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRRT3Q5FWE3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRRT3Q5FWE3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRRT3Q5FWE3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PRRT3Q5FWE3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRRT3Q5FWE3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRRT3Q5FWE3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRRT3Q5FWE3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRRT3Q5FWE3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRRT3Q5FWE3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRRT3Q5FWE3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRRT3Q5FWE3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRRT3Q5FWE3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRRT3Q5FWE3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRRT3Q5FWE3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRRT3Q5FWE3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRRT3Q5FWE3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRRT3Q5FWE3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRRT3Q5FWE3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRRT3Q5FWE3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRRT3Q5FWE3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRRT3Q5FWE3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRRT3Q5FWE3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRRT3Q5FWE3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRRT3Q5FWE3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRRT3Q5FWE3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRRT3Q5FWE3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRRT3Q5FWE3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRRT3Q5FWE3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRRT3Q5FWE3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRRT3Q5FWE3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRRT3Q5FWE3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRRT3Q5FWE3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRRT3Q5FWE3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRRT3Q5FWE3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRRT3Q5FWE3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRRT3Q5FWE3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRRT3Q5FWE3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRRT3Q5FWE3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRRT3Q5FWE3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRRT3Q5FWE3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRRT3Q5FWE3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRRT3Q5FWE3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRRT3Q5FWE3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRRT3Q5FWE3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRRT3Q5FWE3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRRT3Q5FWE3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRRT3Q5FWE3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRRT3Q5FWE3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRRT3Q5FWE3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRRT3Q5FWE3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRRT3Q5FWE3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRRT3Q5FWE3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRRT3Q5FWE3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRRT3Q5FWE3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRRT3Q5FWE3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms