Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KHDC1Q4VXA5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KHDC1Q4VXA5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KHDC1Q4VXA5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KHDC1Q4VXA5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KHDC1Q4VXA5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KHDC1Q4VXA5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KHDC1Q4VXA5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KHDC1Q4VXA5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KHDC1Q4VXA5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KHDC1Q4VXA5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KHDC1Q4VXA5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KHDC1Q4VXA5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KHDC1Q4VXA5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KHDC1Q4VXA5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KHDC1Q4VXA5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KHDC1Q4VXA5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KHDC1Q4VXA5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KHDC1Q4VXA5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KHDC1Q4VXA5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KHDC1Q4VXA5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KHDC1Q4VXA5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KHDC1Q4VXA5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KHDC1Q4VXA5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KHDC1Q4VXA5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KHDC1Q4VXA5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KHDC1Q4VXA5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KHDC1Q4VXA5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KHDC1Q4VXA5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KHDC1Q4VXA5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KHDC1Q4VXA5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KHDC1Q4VXA5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KHDC1Q4VXA5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KHDC1Q4VXA5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KHDC1Q4VXA5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KHDC1Q4VXA5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KHDC1Q4VXA5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KHDC1Q4VXA5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KHDC1Q4VXA5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KHDC1Q4VXA5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KHDC1Q4VXA5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KHDC1Q4VXA5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KHDC1Q4VXA5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KHDC1Q4VXA5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KHDC1Q4VXA5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KHDC1Q4VXA5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KHDC1Q4VXA5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KHDC1Q4VXA5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KHDC1Q4VXA5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KHDC1Q4VXA5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KHDC1Q4VXA5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KHDC1Q4VXA5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KHDC1Q4VXA5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KHDC1Q4VXA5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KHDC1Q4VXA5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KHDC1Q4VXA5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KHDC1Q4VXA5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KHDC1Q4VXA5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KHDC1Q4VXA5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KHDC1Q4VXA5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KHDC1Q4VXA5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KHDC1Q4VXA5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KHDC1Q4VXA5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KHDC1Q4VXA5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KHDC1Q4VXA5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KHDC1Q4VXA5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KHDC1Q4VXA5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KHDC1Q4VXA5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KHDC1Q4VXA5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KHDC1Q4VXA5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KHDC1Q4VXA5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KHDC1Q4VXA5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KHDC1Q4VXA5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KHDC1Q4VXA5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KHDC1Q4VXA5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KHDC1Q4VXA5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KHDC1Q4VXA5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KHDC1Q4VXA5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KHDC1Q4VXA5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KHDC1Q4VXA5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KHDC1Q4VXA5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KHDC1Q4VXA5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KHDC1Q4VXA5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KHDC1Q4VXA5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KHDC1Q4VXA5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KHDC1Q4VXA5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KHDC1Q4VXA5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KHDC1Q4VXA5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KHDC1Q4VXA5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KHDC1Q4VXA5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KHDC1Q4VXA5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KHDC1Q4VXA5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KHDC1Q4VXA5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KHDC1Q4VXA5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KHDC1Q4VXA5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KHDC1Q4VXA5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KHDC1Q4VXA5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KHDC1Q4VXA5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KHDC1Q4VXA5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KHDC1Q4VXA5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms