Protein–RNA interactions for Protein: Q3V5L5

MGAT5B, Alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase B, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT5BQ3V5L5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MGAT5BQ3V5L5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MGAT5BQ3V5L5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MGAT5BQ3V5L5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MGAT5BQ3V5L5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MGAT5BQ3V5L5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MGAT5BQ3V5L5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MGAT5BQ3V5L5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MGAT5BQ3V5L5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MGAT5BQ3V5L5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MGAT5BQ3V5L5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MGAT5BQ3V5L5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MGAT5BQ3V5L5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MGAT5BQ3V5L5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MGAT5BQ3V5L5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MGAT5BQ3V5L5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MGAT5BQ3V5L5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MGAT5BQ3V5L5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MGAT5BQ3V5L5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MGAT5BQ3V5L5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MGAT5BQ3V5L5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MGAT5BQ3V5L5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MGAT5BQ3V5L5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MGAT5BQ3V5L5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MGAT5BQ3V5L5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MGAT5BQ3V5L5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MGAT5BQ3V5L5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MGAT5BQ3V5L5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MGAT5BQ3V5L5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MGAT5BQ3V5L5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MGAT5BQ3V5L5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MGAT5BQ3V5L5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MGAT5BQ3V5L5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MGAT5BQ3V5L5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MGAT5BQ3V5L5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MGAT5BQ3V5L5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MGAT5BQ3V5L5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MGAT5BQ3V5L5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MGAT5BQ3V5L5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MGAT5BQ3V5L5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MGAT5BQ3V5L5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MGAT5BQ3V5L5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MGAT5BQ3V5L5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MGAT5BQ3V5L5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MGAT5BQ3V5L5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MGAT5BQ3V5L5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MGAT5BQ3V5L5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MGAT5BQ3V5L5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MGAT5BQ3V5L5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MGAT5BQ3V5L5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MGAT5BQ3V5L5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MGAT5BQ3V5L5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MGAT5BQ3V5L5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MGAT5BQ3V5L5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MGAT5BQ3V5L5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MGAT5BQ3V5L5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MGAT5BQ3V5L5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MGAT5BQ3V5L5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MGAT5BQ3V5L5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MGAT5BQ3V5L5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MGAT5BQ3V5L5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MGAT5BQ3V5L5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MGAT5BQ3V5L5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MGAT5BQ3V5L5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MGAT5BQ3V5L5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MGAT5BQ3V5L5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MGAT5BQ3V5L5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MGAT5BQ3V5L5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MGAT5BQ3V5L5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MGAT5BQ3V5L5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MGAT5BQ3V5L5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MGAT5BQ3V5L5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MGAT5BQ3V5L5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MGAT5BQ3V5L5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MGAT5BQ3V5L5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MGAT5BQ3V5L5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MGAT5BQ3V5L5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MGAT5BQ3V5L5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MGAT5BQ3V5L5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MGAT5BQ3V5L5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MGAT5BQ3V5L5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MGAT5BQ3V5L5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MGAT5BQ3V5L5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MGAT5BQ3V5L5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MGAT5BQ3V5L5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MGAT5BQ3V5L5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MGAT5BQ3V5L5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MGAT5BQ3V5L5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MGAT5BQ3V5L5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MGAT5BQ3V5L5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MGAT5BQ3V5L5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MGAT5BQ3V5L5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MGAT5BQ3V5L5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MGAT5BQ3V5L5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MGAT5BQ3V5L5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MGAT5BQ3V5L5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MGAT5BQ3V5L5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MGAT5BQ3V5L5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MGAT5BQ3V5L5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MGAT5BQ3V5L5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms