Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TCEA2Q15560 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCEA2Q15560 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCEA2Q15560 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TCEA2Q15560 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TCEA2Q15560 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TCEA2Q15560 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCEA2Q15560 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCEA2Q15560 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCEA2Q15560 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCEA2Q15560 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCEA2Q15560 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCEA2Q15560 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCEA2Q15560 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCEA2Q15560 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCEA2Q15560 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCEA2Q15560 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCEA2Q15560 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCEA2Q15560 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCEA2Q15560 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCEA2Q15560 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCEA2Q15560 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCEA2Q15560 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCEA2Q15560 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCEA2Q15560 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCEA2Q15560 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCEA2Q15560 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCEA2Q15560 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCEA2Q15560 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCEA2Q15560 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCEA2Q15560 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCEA2Q15560 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCEA2Q15560 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCEA2Q15560 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCEA2Q15560 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCEA2Q15560 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCEA2Q15560 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCEA2Q15560 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCEA2Q15560 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCEA2Q15560 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCEA2Q15560 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCEA2Q15560 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TCEA2Q15560 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCEA2Q15560 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCEA2Q15560 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TCEA2Q15560 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCEA2Q15560 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCEA2Q15560 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCEA2Q15560 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCEA2Q15560 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCEA2Q15560 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TCEA2Q15560 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCEA2Q15560 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCEA2Q15560 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCEA2Q15560 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCEA2Q15560 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCEA2Q15560 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCEA2Q15560 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCEA2Q15560 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCEA2Q15560 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCEA2Q15560 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCEA2Q15560 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCEA2Q15560 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCEA2Q15560 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCEA2Q15560 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCEA2Q15560 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCEA2Q15560 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCEA2Q15560 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCEA2Q15560 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCEA2Q15560 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCEA2Q15560 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCEA2Q15560 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCEA2Q15560 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCEA2Q15560 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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