Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
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