Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR1D2Q14995 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1D2Q14995 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NR1D2Q14995 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1D2Q14995 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms