Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CNGB1Q14028 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CNGB1Q14028 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CNGB1Q14028 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CNGB1Q14028 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
CNGB1Q14028 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.25
CNGB1Q14028 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CNGB1Q14028 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CNGB1Q14028 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CNGB1Q14028 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CNGB1Q14028 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CNGB1Q14028 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
CNGB1Q14028 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
CNGB1Q14028 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CNGB1Q14028 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CNGB1Q14028 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CNGB1Q14028 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CNGB1Q14028 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CNGB1Q14028 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CNGB1Q14028 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CNGB1Q14028 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.22
CNGB1Q14028 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CNGB1Q14028 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CNGB1Q14028 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CNGB1Q14028 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CNGB1Q14028 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CNGB1Q14028 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CNGB1Q14028 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CNGB1Q14028 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CNGB1Q14028 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CNGB1Q14028 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CNGB1Q14028 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CNGB1Q14028 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CNGB1Q14028 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CNGB1Q14028 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CNGB1Q14028 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CNGB1Q14028 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CNGB1Q14028 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CNGB1Q14028 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CNGB1Q14028 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms