Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1CQ13936 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1CQ13936 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1CQ13936 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1CQ13936 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1CQ13936 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1CQ13936 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1CQ13936 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1CQ13936 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1CQ13936 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1CQ13936 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1CQ13936 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1CQ13936 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1CQ13936 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1CQ13936 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1CQ13936 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1CQ13936 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1CQ13936 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1CQ13936 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CACNA1CQ13936 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1CQ13936 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1CQ13936 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1CQ13936 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1CQ13936 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1CQ13936 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1CQ13936 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1CQ13936 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1CQ13936 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1CQ13936 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1CQ13936 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1CQ13936 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1CQ13936 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1CQ13936 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1CQ13936 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CACNA1CQ13936 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1CQ13936 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1CQ13936 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1CQ13936 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1CQ13936 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1CQ13936 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1CQ13936 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1CQ13936 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1CQ13936 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1CQ13936 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1CQ13936 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1CQ13936 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1CQ13936 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1CQ13936 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1CQ13936 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1CQ13936 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1CQ13936 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1CQ13936 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1CQ13936 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1CQ13936 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNA1CQ13936 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1CQ13936 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1CQ13936 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1CQ13936 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1CQ13936 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1CQ13936 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1CQ13936 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1CQ13936 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1CQ13936 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1CQ13936 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1CQ13936 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1CQ13936 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1CQ13936 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1CQ13936 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1CQ13936 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1CQ13936 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1CQ13936 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1CQ13936 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1CQ13936 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1CQ13936 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1CQ13936 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1CQ13936 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1CQ13936 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1CQ13936 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1CQ13936 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1CQ13936 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1CQ13936 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
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