Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFX1Q12986 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFX1Q12986 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFX1Q12986 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFX1Q12986 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFX1Q12986 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFX1Q12986 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFX1Q12986 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFX1Q12986 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFX1Q12986 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFX1Q12986 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFX1Q12986 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFX1Q12986 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFX1Q12986 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFX1Q12986 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NFX1Q12986 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFX1Q12986 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFX1Q12986 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFX1Q12986 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFX1Q12986 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NFX1Q12986 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFX1Q12986 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NFX1Q12986 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFX1Q12986 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms