Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CYP4F3Q08477 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CYP4F3Q08477 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP4F3Q08477 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP4F3Q08477 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP4F3Q08477 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP4F3Q08477 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP4F3Q08477 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP4F3Q08477 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP4F3Q08477 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4F3Q08477 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4F3Q08477 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4F3Q08477 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4F3Q08477 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4F3Q08477 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4F3Q08477 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4F3Q08477 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4F3Q08477 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4F3Q08477 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP4F3Q08477 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP4F3Q08477 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP4F3Q08477 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP4F3Q08477 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP4F3Q08477 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CYP4F3Q08477 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4F3Q08477 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4F3Q08477 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4F3Q08477 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4F3Q08477 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4F3Q08477 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4F3Q08477 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP4F3Q08477 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP4F3Q08477 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP4F3Q08477 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP4F3Q08477 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP4F3Q08477 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP4F3Q08477 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP4F3Q08477 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4F3Q08477 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4F3Q08477 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4F3Q08477 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4F3Q08477 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4F3Q08477 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4F3Q08477 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP4F3Q08477 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP4F3Q08477 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP4F3Q08477 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP4F3Q08477 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4F3Q08477 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4F3Q08477 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F3Q08477 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F3Q08477 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F3Q08477 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F3Q08477 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F3Q08477 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F3Q08477 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F3Q08477 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F3Q08477 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F3Q08477 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F3Q08477 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4F3Q08477 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4F3Q08477 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4F3Q08477 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4F3Q08477 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4F3Q08477 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4F3Q08477 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4F3Q08477 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4F3Q08477 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP4F3Q08477 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4F3Q08477 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4F3Q08477 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4F3Q08477 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4F3Q08477 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4F3Q08477 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F3Q08477 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F3Q08477 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F3Q08477 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F3Q08477 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F3Q08477 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4F3Q08477 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4F3Q08477 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4F3Q08477 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP4F3Q08477 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP4F3Q08477 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP4F3Q08477 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP4F3Q08477 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms