Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SATB1Q01826 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SATB1Q01826 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SATB1Q01826 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SATB1Q01826 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SATB1Q01826 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SATB1Q01826 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SATB1Q01826 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SATB1Q01826 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SATB1Q01826 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SATB1Q01826 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SATB1Q01826 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SATB1Q01826 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SATB1Q01826 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SATB1Q01826 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SATB1Q01826 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SATB1Q01826 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SATB1Q01826 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SATB1Q01826 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SATB1Q01826 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SATB1Q01826 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SATB1Q01826 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SATB1Q01826 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SATB1Q01826 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SATB1Q01826 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SATB1Q01826 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SATB1Q01826 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SATB1Q01826 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SATB1Q01826 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SATB1Q01826 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SATB1Q01826 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SATB1Q01826 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SATB1Q01826 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SATB1Q01826 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SATB1Q01826 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SATB1Q01826 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SATB1Q01826 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SATB1Q01826 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SATB1Q01826 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SATB1Q01826 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SATB1Q01826 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SATB1Q01826 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SATB1Q01826 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SATB1Q01826 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SATB1Q01826 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SATB1Q01826 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SATB1Q01826 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SATB1Q01826 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SATB1Q01826 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SATB1Q01826 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SATB1Q01826 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SATB1Q01826 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SATB1Q01826 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SATB1Q01826 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SATB1Q01826 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SATB1Q01826 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SATB1Q01826 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SATB1Q01826 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SATB1Q01826 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SATB1Q01826 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SATB1Q01826 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SATB1Q01826 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SATB1Q01826 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SATB1Q01826 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SATB1Q01826 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SATB1Q01826 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SATB1Q01826 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SATB1Q01826 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SATB1Q01826 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SATB1Q01826 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SATB1Q01826 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SATB1Q01826 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms