Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTR3P61158 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTR3P61158 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTR3P61158 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTR3P61158 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTR3P61158 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTR3P61158 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTR3P61158 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTR3P61158 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTR3P61158 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTR3P61158 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTR3P61158 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTR3P61158 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTR3P61158 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTR3P61158 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTR3P61158 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTR3P61158 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTR3P61158 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTR3P61158 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTR3P61158 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTR3P61158 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTR3P61158 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTR3P61158 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTR3P61158 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTR3P61158 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTR3P61158 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTR3P61158 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTR3P61158 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTR3P61158 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTR3P61158 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACTR3P61158 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTR3P61158 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTR3P61158 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTR3P61158 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTR3P61158 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTR3P61158 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTR3P61158 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTR3P61158 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTR3P61158 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTR3P61158 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTR3P61158 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTR3P61158 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTR3P61158 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTR3P61158 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTR3P61158 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTR3P61158 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTR3P61158 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTR3P61158 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTR3P61158 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTR3P61158 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTR3P61158 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTR3P61158 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTR3P61158 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTR3P61158 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACTR3P61158 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACTR3P61158 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACTR3P61158 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTR3P61158 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTR3P61158 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTR3P61158 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTR3P61158 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTR3P61158 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTR3P61158 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTR3P61158 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTR3P61158 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTR3P61158 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTR3P61158 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTR3P61158 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTR3P61158 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTR3P61158 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTR3P61158 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTR3P61158 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTR3P61158 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTR3P61158 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTR3P61158 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTR3P61158 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACTR3P61158 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACTR3P61158 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACTR3P61158 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTR3P61158 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTR3P61158 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTR3P61158 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTR3P61158 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTR3P61158 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTR3P61158 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTR3P61158 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTR3P61158 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTR3P61158 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTR3P61158 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTR3P61158 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTR3P61158 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTR3P61158 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTR3P61158 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTR3P61158 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTR3P61158 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTR3P61158 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTR3P61158 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTR3P61158 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTR3P61158 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTR3P61158 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms