Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EMP3P54852 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EMP3P54852 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EMP3P54852 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EMP3P54852 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EMP3P54852 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EMP3P54852 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EMP3P54852 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EMP3P54852 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EMP3P54852 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EMP3P54852 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EMP3P54852 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EMP3P54852 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EMP3P54852 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EMP3P54852 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EMP3P54852 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EMP3P54852 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EMP3P54852 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EMP3P54852 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EMP3P54852 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EMP3P54852 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EMP3P54852 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EMP3P54852 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EMP3P54852 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EMP3P54852 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EMP3P54852 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EMP3P54852 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EMP3P54852 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EMP3P54852 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EMP3P54852 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EMP3P54852 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EMP3P54852 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EMP3P54852 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EMP3P54852 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EMP3P54852 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EMP3P54852 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EMP3P54852 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EMP3P54852 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EMP3P54852 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EMP3P54852 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EMP3P54852 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EMP3P54852 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EMP3P54852 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EMP3P54852 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EMP3P54852 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EMP3P54852 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EMP3P54852 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EMP3P54852 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EMP3P54852 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EMP3P54852 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EMP3P54852 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EMP3P54852 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMP3P54852 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMP3P54852 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMP3P54852 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMP3P54852 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMP3P54852 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMP3P54852 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMP3P54852 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMP3P54852 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EMP3P54852 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EMP3P54852 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EMP3P54852 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMP3P54852 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMP3P54852 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMP3P54852 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMP3P54852 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EMP3P54852 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMP3P54852 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMP3P54852 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMP3P54852 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMP3P54852 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMP3P54852 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMP3P54852 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMP3P54852 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EMP3P54852 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EMP3P54852 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EMP3P54852 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EMP3P54852 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EMP3P54852 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EMP3P54852 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMP3P54852 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMP3P54852 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMP3P54852 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMP3P54852 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMP3P54852 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMP3P54852 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EMP3P54852 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EMP3P54852 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EMP3P54852 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EMP3P54852 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMP3P54852 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMP3P54852 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMP3P54852 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMP3P54852 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EMP3P54852 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EMP3P54852 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EMP3P54852 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EMP3P54852 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EMP3P54852 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms