Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMD8P48556 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMD8P48556 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMD8P48556 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMD8P48556 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMD8P48556 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMD8P48556 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMD8P48556 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD8P48556 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD8P48556 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD8P48556 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD8P48556 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMD8P48556 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMD8P48556 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSMD8P48556 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMD8P48556 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD8P48556 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD8P48556 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD8P48556 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD8P48556 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD8P48556 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD8P48556 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD8P48556 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD8P48556 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD8P48556 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD8P48556 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD8P48556 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD8P48556 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD8P48556 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD8P48556 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD8P48556 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD8P48556 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD8P48556 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD8P48556 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD8P48556 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD8P48556 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD8P48556 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD8P48556 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD8P48556 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD8P48556 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD8P48556 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD8P48556 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD8P48556 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMD8P48556 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMD8P48556 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD8P48556 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD8P48556 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD8P48556 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD8P48556 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD8P48556 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMD8P48556 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMD8P48556 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD8P48556 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD8P48556 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD8P48556 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD8P48556 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD8P48556 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD8P48556 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD8P48556 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD8P48556 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMD8P48556 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMD8P48556 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD8P48556 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD8P48556 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms