Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALDH1A3P47895 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALDH1A3P47895 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ALDH1A3P47895 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ALDH1A3P47895 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms