Protein–RNA interactions for Protein: P43487

RANBP1, Ran-specific GTPase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP1P43487 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANBP1P43487 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANBP1P43487 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANBP1P43487 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANBP1P43487 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANBP1P43487 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANBP1P43487 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANBP1P43487 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANBP1P43487 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANBP1P43487 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANBP1P43487 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANBP1P43487 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANBP1P43487 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANBP1P43487 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANBP1P43487 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RANBP1P43487 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANBP1P43487 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANBP1P43487 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANBP1P43487 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANBP1P43487 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANBP1P43487 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RANBP1P43487 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RANBP1P43487 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANBP1P43487 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANBP1P43487 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANBP1P43487 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RANBP1P43487 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANBP1P43487 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANBP1P43487 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANBP1P43487 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANBP1P43487 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANBP1P43487 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANBP1P43487 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANBP1P43487 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANBP1P43487 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANBP1P43487 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANBP1P43487 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANBP1P43487 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANBP1P43487 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANBP1P43487 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANBP1P43487 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANBP1P43487 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANBP1P43487 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANBP1P43487 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RANBP1P43487 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANBP1P43487 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RANBP1P43487 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANBP1P43487 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANBP1P43487 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANBP1P43487 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANBP1P43487 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANBP1P43487 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANBP1P43487 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANBP1P43487 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANBP1P43487 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANBP1P43487 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANBP1P43487 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANBP1P43487 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANBP1P43487 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANBP1P43487 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANBP1P43487 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANBP1P43487 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANBP1P43487 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANBP1P43487 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANBP1P43487 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANBP1P43487 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANBP1P43487 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANBP1P43487 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANBP1P43487 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANBP1P43487 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANBP1P43487 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANBP1P43487 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANBP1P43487 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANBP1P43487 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANBP1P43487 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANBP1P43487 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RANBP1P43487 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANBP1P43487 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANBP1P43487 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANBP1P43487 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANBP1P43487 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANBP1P43487 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANBP1P43487 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANBP1P43487 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANBP1P43487 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANBP1P43487 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANBP1P43487 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANBP1P43487 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANBP1P43487 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANBP1P43487 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANBP1P43487 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANBP1P43487 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANBP1P43487 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANBP1P43487 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANBP1P43487 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RANBP1P43487 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms