Protein–RNA interactions for Protein: P27352

GIF, Gastric intrinsic factor, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIFP27352 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GIFP27352 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GIFP27352 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIFP27352 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIFP27352 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIFP27352 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIFP27352 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIFP27352 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIFP27352 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIFP27352 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIFP27352 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIFP27352 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GIFP27352 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIFP27352 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIFP27352 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GIFP27352 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIFP27352 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIFP27352 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIFP27352 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIFP27352 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIFP27352 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIFP27352 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIFP27352 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIFP27352 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIFP27352 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIFP27352 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIFP27352 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIFP27352 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIFP27352 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIFP27352 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIFP27352 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIFP27352 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIFP27352 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIFP27352 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIFP27352 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIFP27352 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIFP27352 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIFP27352 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIFP27352 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIFP27352 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIFP27352 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIFP27352 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIFP27352 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIFP27352 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GIFP27352 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIFP27352 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIFP27352 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIFP27352 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIFP27352 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIFP27352 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIFP27352 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIFP27352 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIFP27352 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIFP27352 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GIFP27352 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIFP27352 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GIFP27352 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIFP27352 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GIFP27352 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIFP27352 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GIFP27352 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIFP27352 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIFP27352 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIFP27352 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIFP27352 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIFP27352 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIFP27352 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIFP27352 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIFP27352 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIFP27352 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIFP27352 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIFP27352 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIFP27352 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIFP27352 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIFP27352 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIFP27352 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIFP27352 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIFP27352 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIFP27352 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIFP27352 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIFP27352 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIFP27352 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GIFP27352 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GIFP27352 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GIFP27352 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GIFP27352 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GIFP27352 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GIFP27352 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GIFP27352 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GIFP27352 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GIFP27352 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GIFP27352 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIFP27352 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIFP27352 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIFP27352 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIFP27352 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIFP27352 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GIFP27352 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIFP27352 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIFP27352 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms