Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF7P17544 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF7P17544 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATF7P17544 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATF7P17544 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATF7P17544 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATF7P17544 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATF7P17544 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATF7P17544 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATF7P17544 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATF7P17544 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATF7P17544 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ATF7P17544 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATF7P17544 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ATF7P17544 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATF7P17544 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF7P17544 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF7P17544 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF7P17544 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF7P17544 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF7P17544 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF7P17544 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF7P17544 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF7P17544 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF7P17544 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF7P17544 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF7P17544 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF7P17544 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF7P17544 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF7P17544 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF7P17544 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF7P17544 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ATF7P17544 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATF7P17544 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF7P17544 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF7P17544 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF7P17544 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF7P17544 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF7P17544 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF7P17544 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF7P17544 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF7P17544 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF7P17544 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF7P17544 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF7P17544 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF7P17544 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF7P17544 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF7P17544 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF7P17544 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF7P17544 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF7P17544 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATF7P17544 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATF7P17544 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATF7P17544 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATF7P17544 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATF7P17544 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATF7P17544 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATF7P17544 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATF7P17544 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATF7P17544 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATF7P17544 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATF7P17544 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATF7P17544 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATF7P17544 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF7P17544 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF7P17544 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF7P17544 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF7P17544 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF7P17544 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF7P17544 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF7P17544 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF7P17544 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATF7P17544 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF7P17544 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF7P17544 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF7P17544 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF7P17544 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF7P17544 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF7P17544 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF7P17544 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF7P17544 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF7P17544 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF7P17544 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF7P17544 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF7P17544 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF7P17544 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF7P17544 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF7P17544 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF7P17544 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF7P17544 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF7P17544 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF7P17544 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF7P17544 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF7P17544 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF7P17544 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF7P17544 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF7P17544 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF7P17544 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF7P17544 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF7P17544 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms