Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRGAP2BP0DMP2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRGAP2BP0DMP2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRGAP2BP0DMP2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRGAP2BP0DMP2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRGAP2BP0DMP2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRGAP2BP0DMP2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRGAP2BP0DMP2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRGAP2BP0DMP2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRGAP2BP0DMP2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRGAP2BP0DMP2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRGAP2BP0DMP2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRGAP2BP0DMP2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRGAP2BP0DMP2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRGAP2BP0DMP2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRGAP2BP0DMP2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRGAP2BP0DMP2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRGAP2BP0DMP2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRGAP2BP0DMP2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SRGAP2BP0DMP2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SRGAP2BP0DMP2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SRGAP2BP0DMP2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRGAP2BP0DMP2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SRGAP2BP0DMP2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP2BP0DMP2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP2BP0DMP2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP2BP0DMP2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRGAP2BP0DMP2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SRGAP2BP0DMP2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SRGAP2BP0DMP2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRGAP2BP0DMP2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRGAP2BP0DMP2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRGAP2BP0DMP2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRGAP2BP0DMP2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRGAP2BP0DMP2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRGAP2BP0DMP2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRGAP2BP0DMP2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SRGAP2BP0DMP2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRGAP2BP0DMP2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRGAP2BP0DMP2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRGAP2BP0DMP2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRGAP2BP0DMP2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRGAP2BP0DMP2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRGAP2BP0DMP2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP2BP0DMP2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP2BP0DMP2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRGAP2BP0DMP2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRGAP2BP0DMP2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRGAP2BP0DMP2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRGAP2BP0DMP2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRGAP2BP0DMP2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRGAP2BP0DMP2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRGAP2BP0DMP2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRGAP2BP0DMP2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRGAP2BP0DMP2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRGAP2BP0DMP2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRGAP2BP0DMP2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRGAP2BP0DMP2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRGAP2BP0DMP2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRGAP2BP0DMP2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRGAP2BP0DMP2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRGAP2BP0DMP2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRGAP2BP0DMP2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRGAP2BP0DMP2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRGAP2BP0DMP2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRGAP2BP0DMP2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SRGAP2BP0DMP2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SRGAP2BP0DMP2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SRGAP2BP0DMP2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRGAP2BP0DMP2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRGAP2BP0DMP2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRGAP2BP0DMP2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRGAP2BP0DMP2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRGAP2BP0DMP2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRGAP2BP0DMP2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRGAP2BP0DMP2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRGAP2BP0DMP2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP2BP0DMP2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP2BP0DMP2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP2BP0DMP2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRGAP2BP0DMP2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRGAP2BP0DMP2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRGAP2BP0DMP2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRGAP2BP0DMP2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRGAP2BP0DMP2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
SRGAP2BP0DMP2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRGAP2BP0DMP2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRGAP2BP0DMP2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRGAP2BP0DMP2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRGAP2BP0DMP2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRGAP2BP0DMP2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRGAP2BP0DMP2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRGAP2BP0DMP2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRGAP2BP0DMP2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRGAP2BP0DMP2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRGAP2BP0DMP2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRGAP2BP0DMP2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRGAP2BP0DMP2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRGAP2BP0DMP2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRGAP2BP0DMP2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms