Protein–RNA interactions for Protein: P0CG08

GPR89B, Golgi pH regulator B, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR89BP0CG08 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPR89BP0CG08 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPR89BP0CG08 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GPR89BP0CG08 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPR89BP0CG08 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPR89BP0CG08 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GPR89BP0CG08 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPR89BP0CG08 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPR89BP0CG08 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPR89BP0CG08 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPR89BP0CG08 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GPR89BP0CG08 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPR89BP0CG08 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPR89BP0CG08 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPR89BP0CG08 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPR89BP0CG08 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPR89BP0CG08 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPR89BP0CG08 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GPR89BP0CG08 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPR89BP0CG08 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPR89BP0CG08 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GPR89BP0CG08 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPR89BP0CG08 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPR89BP0CG08 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPR89BP0CG08 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPR89BP0CG08 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GPR89BP0CG08 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPR89BP0CG08 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPR89BP0CG08 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPR89BP0CG08 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPR89BP0CG08 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPR89BP0CG08 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPR89BP0CG08 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPR89BP0CG08 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPR89BP0CG08 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPR89BP0CG08 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPR89BP0CG08 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPR89BP0CG08 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPR89BP0CG08 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPR89BP0CG08 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GPR89BP0CG08 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPR89BP0CG08 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPR89BP0CG08 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPR89BP0CG08 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPR89BP0CG08 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPR89BP0CG08 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPR89BP0CG08 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPR89BP0CG08 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPR89BP0CG08 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPR89BP0CG08 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPR89BP0CG08 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPR89BP0CG08 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPR89BP0CG08 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPR89BP0CG08 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPR89BP0CG08 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPR89BP0CG08 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPR89BP0CG08 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPR89BP0CG08 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPR89BP0CG08 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPR89BP0CG08 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GPR89BP0CG08 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GPR89BP0CG08 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPR89BP0CG08 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPR89BP0CG08 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GPR89BP0CG08 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPR89BP0CG08 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPR89BP0CG08 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPR89BP0CG08 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPR89BP0CG08 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPR89BP0CG08 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPR89BP0CG08 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPR89BP0CG08 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPR89BP0CG08 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPR89BP0CG08 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPR89BP0CG08 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPR89BP0CG08 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPR89BP0CG08 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPR89BP0CG08 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPR89BP0CG08 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPR89BP0CG08 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPR89BP0CG08 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPR89BP0CG08 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GPR89BP0CG08 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPR89BP0CG08 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPR89BP0CG08 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPR89BP0CG08 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPR89BP0CG08 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPR89BP0CG08 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPR89BP0CG08 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPR89BP0CG08 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPR89BP0CG08 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPR89BP0CG08 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPR89BP0CG08 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPR89BP0CG08 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPR89BP0CG08 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPR89BP0CG08 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPR89BP0CG08 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GPR89BP0CG08 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPR89BP0CG08 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPR89BP0CG08 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms