Protein–RNA interactions for Protein: P09105

HBQ1, Hemoglobin subunit theta-1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBQ1P09105 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HBQ1P09105 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HBQ1P09105 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HBQ1P09105 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HBQ1P09105 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HBQ1P09105 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HBQ1P09105 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HBQ1P09105 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HBQ1P09105 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HBQ1P09105 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HBQ1P09105 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HBQ1P09105 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HBQ1P09105 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HBQ1P09105 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HBQ1P09105 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HBQ1P09105 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HBQ1P09105 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HBQ1P09105 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HBQ1P09105 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HBQ1P09105 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HBQ1P09105 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HBQ1P09105 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HBQ1P09105 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HBQ1P09105 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HBQ1P09105 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HBQ1P09105 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HBQ1P09105 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HBQ1P09105 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HBQ1P09105 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HBQ1P09105 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HBQ1P09105 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HBQ1P09105 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HBQ1P09105 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HBQ1P09105 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HBQ1P09105 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HBQ1P09105 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HBQ1P09105 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HBQ1P09105 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HBQ1P09105 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HBQ1P09105 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HBQ1P09105 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HBQ1P09105 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HBQ1P09105 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HBQ1P09105 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HBQ1P09105 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HBQ1P09105 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HBQ1P09105 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HBQ1P09105 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HBQ1P09105 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HBQ1P09105 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HBQ1P09105 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HBQ1P09105 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HBQ1P09105 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HBQ1P09105 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HBQ1P09105 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HBQ1P09105 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HBQ1P09105 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HBQ1P09105 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HBQ1P09105 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HBQ1P09105 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HBQ1P09105 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HBQ1P09105 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HBQ1P09105 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HBQ1P09105 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HBQ1P09105 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HBQ1P09105 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HBQ1P09105 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms