Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GJB1P08034 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GJB1P08034 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GJB1P08034 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GJB1P08034 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GJB1P08034 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
GJB1P08034 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GJB1P08034 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GJB1P08034 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GJB1P08034 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GJB1P08034 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GJB1P08034 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GJB1P08034 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GJB1P08034 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GJB1P08034 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
GJB1P08034 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GJB1P08034 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJB1P08034 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
GJB1P08034 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJB1P08034 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJB1P08034 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJB1P08034 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GJB1P08034 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GJB1P08034 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GJB1P08034 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GJB1P08034 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJB1P08034 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJB1P08034 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJB1P08034 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJB1P08034 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJB1P08034 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJB1P08034 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJB1P08034 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJB1P08034 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJB1P08034 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJB1P08034 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJB1P08034 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJB1P08034 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJB1P08034 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJB1P08034 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJB1P08034 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJB1P08034 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJB1P08034 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJB1P08034 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJB1P08034 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJB1P08034 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJB1P08034 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GJB1P08034 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJB1P08034 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJB1P08034 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJB1P08034 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJB1P08034 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJB1P08034 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJB1P08034 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJB1P08034 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJB1P08034 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJB1P08034 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJB1P08034 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
GJB1P08034 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GJB1P08034 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GJB1P08034 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJB1P08034 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJB1P08034 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GJB1P08034 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GJB1P08034 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GJB1P08034 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GJB1P08034 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
GJB1P08034 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJB1P08034 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJB1P08034 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJB1P08034 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJB1P08034 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJB1P08034 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJB1P08034 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJB1P08034 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GJB1P08034 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJB1P08034 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJB1P08034 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJB1P08034 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJB1P08034 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJB1P08034 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJB1P08034 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJB1P08034 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJB1P08034 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJB1P08034 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJB1P08034 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GJB1P08034 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GJB1P08034 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GJB1P08034 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
GJB1P08034 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
GJB1P08034 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GJB1P08034 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GJB1P08034 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GJB1P08034 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GJB1P08034 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GJB1P08034 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJB1P08034 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJB1P08034 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJB1P08034 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GJB1P08034 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms