Protein–RNA interactions for Protein: P07204

THBD, Thrombomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBDP07204 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THBDP07204 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THBDP07204 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
THBDP07204 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
THBDP07204 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THBDP07204 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THBDP07204 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THBDP07204 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THBDP07204 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THBDP07204 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THBDP07204 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THBDP07204 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THBDP07204 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THBDP07204 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THBDP07204 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THBDP07204 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THBDP07204 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THBDP07204 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THBDP07204 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THBDP07204 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THBDP07204 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THBDP07204 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
THBDP07204 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THBDP07204 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THBDP07204 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
THBDP07204 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
THBDP07204 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
THBDP07204 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THBDP07204 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THBDP07204 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THBDP07204 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
THBDP07204 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THBDP07204 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THBDP07204 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THBDP07204 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THBDP07204 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THBDP07204 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THBDP07204 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THBDP07204 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
THBDP07204 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
THBDP07204 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
THBDP07204 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THBDP07204 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THBDP07204 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THBDP07204 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THBDP07204 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THBDP07204 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THBDP07204 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THBDP07204 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THBDP07204 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THBDP07204 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THBDP07204 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THBDP07204 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
THBDP07204 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THBDP07204 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THBDP07204 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THBDP07204 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THBDP07204 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THBDP07204 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THBDP07204 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THBDP07204 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THBDP07204 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THBDP07204 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THBDP07204 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THBDP07204 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THBDP07204 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THBDP07204 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THBDP07204 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THBDP07204 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THBDP07204 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THBDP07204 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THBDP07204 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THBDP07204 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THBDP07204 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THBDP07204 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THBDP07204 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THBDP07204 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THBDP07204 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THBDP07204 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THBDP07204 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THBDP07204 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THBDP07204 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THBDP07204 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
THBDP07204 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THBDP07204 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THBDP07204 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THBDP07204 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THBDP07204 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THBDP07204 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THBDP07204 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THBDP07204 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THBDP07204 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THBDP07204 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THBDP07204 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THBDP07204 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THBDP07204 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THBDP07204 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THBDP07204 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THBDP07204 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THBDP07204 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms