Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CALB1P05937 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CALB1P05937 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CALB1P05937 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALB1P05937 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CALB1P05937 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALB1P05937 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CALB1P05937 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALB1P05937 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALB1P05937 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALB1P05937 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CALB1P05937 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CALB1P05937 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CALB1P05937 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CALB1P05937 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALB1P05937 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALB1P05937 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALB1P05937 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALB1P05937 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALB1P05937 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALB1P05937 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALB1P05937 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALB1P05937 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALB1P05937 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALB1P05937 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALB1P05937 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALB1P05937 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALB1P05937 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALB1P05937 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALB1P05937 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CALB1P05937 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CALB1P05937 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CALB1P05937 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CALB1P05937 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CALB1P05937 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CALB1P05937 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CALB1P05937 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CALB1P05937 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CALB1P05937 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CALB1P05937 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CALB1P05937 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CALB1P05937 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CALB1P05937 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CALB1P05937 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CALB1P05937 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CALB1P05937 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CALB1P05937 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CALB1P05937 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CALB1P05937 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALB1P05937 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALB1P05937 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALB1P05937 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALB1P05937 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALB1P05937 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALB1P05937 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALB1P05937 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALB1P05937 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALB1P05937 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALB1P05937 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CALB1P05937 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALB1P05937 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CALB1P05937 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CALB1P05937 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CALB1P05937 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CALB1P05937 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CALB1P05937 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALB1P05937 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALB1P05937 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALB1P05937 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALB1P05937 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALB1P05937 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALB1P05937 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALB1P05937 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALB1P05937 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALB1P05937 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALB1P05937 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALB1P05937 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALB1P05937 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CALB1P05937 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALB1P05937 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALB1P05937 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALB1P05937 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALB1P05937 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALB1P05937 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CALB1P05937 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CALB1P05937 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALB1P05937 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALB1P05937 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALB1P05937 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALB1P05937 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALB1P05937 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALB1P05937 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALB1P05937 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALB1P05937 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALB1P05937 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CALB1P05937 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALB1P05937 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALB1P05937 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALB1P05937 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALB1P05937 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms