Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMNAP02545 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMNAP02545 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMNAP02545 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMNAP02545 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMNAP02545 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMNAP02545 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMNAP02545 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMNAP02545 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMNAP02545 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LMNAP02545 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMNAP02545 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMNAP02545 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMNAP02545 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMNAP02545 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMNAP02545 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMNAP02545 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMNAP02545 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMNAP02545 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMNAP02545 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMNAP02545 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMNAP02545 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMNAP02545 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMNAP02545 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMNAP02545 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMNAP02545 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMNAP02545 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMNAP02545 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMNAP02545 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMNAP02545 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMNAP02545 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMNAP02545 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMNAP02545 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMNAP02545 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMNAP02545 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMNAP02545 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMNAP02545 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMNAP02545 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNAP02545 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNAP02545 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNAP02545 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMNAP02545 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMNAP02545 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMNAP02545 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMNAP02545 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMNAP02545 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMNAP02545 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMNAP02545 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMNAP02545 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMNAP02545 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMNAP02545 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LMNAP02545 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LMNAP02545 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMNAP02545 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMNAP02545 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMNAP02545 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMNAP02545 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMNAP02545 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMNAP02545 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMNAP02545 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMNAP02545 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMNAP02545 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMNAP02545 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LMNAP02545 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMNAP02545 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMNAP02545 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMNAP02545 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMNAP02545 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMNAP02545 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMNAP02545 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMNAP02545 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMNAP02545 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMNAP02545 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMNAP02545 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMNAP02545 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMNAP02545 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMNAP02545 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMNAP02545 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMNAP02545 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMNAP02545 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LMNAP02545 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMNAP02545 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMNAP02545 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMNAP02545 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMNAP02545 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMNAP02545 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMNAP02545 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMNAP02545 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMNAP02545 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMNAP02545 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNAP02545 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNAP02545 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNAP02545 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMNAP02545 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMNAP02545 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMNAP02545 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMNAP02545 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMNAP02545 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMNAP02545 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMNAP02545 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms