Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALX3O95076 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALX3O95076 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALX3O95076 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALX3O95076 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALX3O95076 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALX3O95076 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALX3O95076 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALX3O95076 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALX3O95076 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX3O95076 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALX3O95076 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALX3O95076 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALX3O95076 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALX3O95076 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALX3O95076 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX3O95076 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX3O95076 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ALX3O95076 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALX3O95076 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALX3O95076 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ALX3O95076 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALX3O95076 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALX3O95076 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALX3O95076 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALX3O95076 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALX3O95076 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALX3O95076 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALX3O95076 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALX3O95076 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ALX3O95076 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALX3O95076 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALX3O95076 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALX3O95076 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALX3O95076 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALX3O95076 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALX3O95076 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALX3O95076 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALX3O95076 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX3O95076 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX3O95076 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX3O95076 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX3O95076 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX3O95076 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX3O95076 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX3O95076 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX3O95076 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX3O95076 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX3O95076 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX3O95076 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX3O95076 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX3O95076 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX3O95076 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX3O95076 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX3O95076 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX3O95076 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX3O95076 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX3O95076 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALX3O95076 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALX3O95076 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ALX3O95076 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ALX3O95076 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALX3O95076 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALX3O95076 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALX3O95076 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALX3O95076 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALX3O95076 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALX3O95076 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALX3O95076 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALX3O95076 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALX3O95076 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALX3O95076 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX3O95076 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX3O95076 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX3O95076 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX3O95076 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALX3O95076 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALX3O95076 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX3O95076 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX3O95076 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX3O95076 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX3O95076 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX3O95076 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX3O95076 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX3O95076 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX3O95076 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX3O95076 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX3O95076 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX3O95076 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX3O95076 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX3O95076 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX3O95076 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX3O95076 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX3O95076 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ALX3O95076 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX3O95076 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX3O95076 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX3O95076 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX3O95076 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX3O95076 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.7 ms