Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNCRIPO60506 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNCRIPO60506 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNCRIPO60506 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNCRIPO60506 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNCRIPO60506 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNCRIPO60506 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNCRIPO60506 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNCRIPO60506 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNCRIPO60506 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNCRIPO60506 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNCRIPO60506 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNCRIPO60506 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNCRIPO60506 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNCRIPO60506 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNCRIPO60506 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNCRIPO60506 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNCRIPO60506 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNCRIPO60506 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNCRIPO60506 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNCRIPO60506 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNCRIPO60506 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNCRIPO60506 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNCRIPO60506 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNCRIPO60506 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNCRIPO60506 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNCRIPO60506 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNCRIPO60506 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNCRIPO60506 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNCRIPO60506 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNCRIPO60506 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNCRIPO60506 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNCRIPO60506 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNCRIPO60506 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNCRIPO60506 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNCRIPO60506 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNCRIPO60506 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNCRIPO60506 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNCRIPO60506 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNCRIPO60506 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNCRIPO60506 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNCRIPO60506 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNCRIPO60506 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNCRIPO60506 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNCRIPO60506 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNCRIPO60506 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNCRIPO60506 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNCRIPO60506 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNCRIPO60506 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNCRIPO60506 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SYNCRIPO60506 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNCRIPO60506 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNCRIPO60506 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNCRIPO60506 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNCRIPO60506 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNCRIPO60506 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNCRIPO60506 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNCRIPO60506 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNCRIPO60506 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNCRIPO60506 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNCRIPO60506 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNCRIPO60506 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNCRIPO60506 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNCRIPO60506 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNCRIPO60506 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms