Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KCNQ3O43525 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KCNQ3O43525 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KCNQ3O43525 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KCNQ3O43525 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KCNQ3O43525 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KCNQ3O43525 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KCNQ3O43525 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KCNQ3O43525 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KCNQ3O43525 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KCNQ3O43525 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KCNQ3O43525 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
KCNQ3O43525 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KCNQ3O43525 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KCNQ3O43525 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KCNQ3O43525 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KCNQ3O43525 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KCNQ3O43525 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
KCNQ3O43525 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KCNQ3O43525 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KCNQ3O43525 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KCNQ3O43525 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KCNQ3O43525 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KCNQ3O43525 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KCNQ3O43525 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KCNQ3O43525 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KCNQ3O43525 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KCNQ3O43525 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KCNQ3O43525 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KCNQ3O43525 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KCNQ3O43525 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KCNQ3O43525 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KCNQ3O43525 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KCNQ3O43525 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KCNQ3O43525 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KCNQ3O43525 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
KCNQ3O43525 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KCNQ3O43525 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
KCNQ3O43525 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
KCNQ3O43525 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KCNQ3O43525 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
KCNQ3O43525 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KCNQ3O43525 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KCNQ3O43525 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KCNQ3O43525 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KCNQ3O43525 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KCNQ3O43525 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
KCNQ3O43525 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KCNQ3O43525 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KCNQ3O43525 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KCNQ3O43525 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KCNQ3O43525 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KCNQ3O43525 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
KCNQ3O43525 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
KCNQ3O43525 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KCNQ3O43525 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KCNQ3O43525 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KCNQ3O43525 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KCNQ3O43525 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KCNQ3O43525 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KCNQ3O43525 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KCNQ3O43525 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
KCNQ3O43525 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KCNQ3O43525 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
KCNQ3O43525 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KCNQ3O43525 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
KCNQ3O43525 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KCNQ3O43525 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KCNQ3O43525 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KCNQ3O43525 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KCNQ3O43525 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
KCNQ3O43525 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KCNQ3O43525 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KCNQ3O43525 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KCNQ3O43525 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KCNQ3O43525 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KCNQ3O43525 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KCNQ3O43525 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KCNQ3O43525 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KCNQ3O43525 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KCNQ3O43525 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
KCNQ3O43525 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KCNQ3O43525 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KCNQ3O43525 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
KCNQ3O43525 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KCNQ3O43525 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KCNQ3O43525 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KCNQ3O43525 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KCNQ3O43525 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KCNQ3O43525 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KCNQ3O43525 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
KCNQ3O43525 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KCNQ3O43525 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KCNQ3O43525 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KCNQ3O43525 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KCNQ3O43525 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KCNQ3O43525 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KCNQ3O43525 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KCNQ3O43525 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KCNQ3O43525 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms