Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSI1O43347 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSI1O43347 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSI1O43347 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MSI1O43347 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MSI1O43347 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MSI1O43347 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MSI1O43347 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MSI1O43347 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MSI1O43347 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MSI1O43347 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MSI1O43347 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MSI1O43347 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MSI1O43347 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MSI1O43347 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSI1O43347 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSI1O43347 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MSI1O43347 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSI1O43347 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSI1O43347 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSI1O43347 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSI1O43347 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MSI1O43347 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSI1O43347 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSI1O43347 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSI1O43347 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MSI1O43347 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSI1O43347 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSI1O43347 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSI1O43347 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSI1O43347 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSI1O43347 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSI1O43347 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSI1O43347 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSI1O43347 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSI1O43347 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSI1O43347 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSI1O43347 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSI1O43347 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSI1O43347 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSI1O43347 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MSI1O43347 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSI1O43347 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSI1O43347 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSI1O43347 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSI1O43347 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSI1O43347 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSI1O43347 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSI1O43347 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSI1O43347 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSI1O43347 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MSI1O43347 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MSI1O43347 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MSI1O43347 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MSI1O43347 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MSI1O43347 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MSI1O43347 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MSI1O43347 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MSI1O43347 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MSI1O43347 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MSI1O43347 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MSI1O43347 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MSI1O43347 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MSI1O43347 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MSI1O43347 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MSI1O43347 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MSI1O43347 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MSI1O43347 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MSI1O43347 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MSI1O43347 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MSI1O43347 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MSI1O43347 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MSI1O43347 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MSI1O43347 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MSI1O43347 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MSI1O43347 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MSI1O43347 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MSI1O43347 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MSI1O43347 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MSI1O43347 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MSI1O43347 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MSI1O43347 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MSI1O43347 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MSI1O43347 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MSI1O43347 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MSI1O43347 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MSI1O43347 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MSI1O43347 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MSI1O43347 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MSI1O43347 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MSI1O43347 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MSI1O43347 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MSI1O43347 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MSI1O43347 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MSI1O43347 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MSI1O43347 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MSI1O43347 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MSI1O43347 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MSI1O43347 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MSI1O43347 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms