Protein–RNA interactions for Protein: O15198

SMAD9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD9O15198 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD9O15198 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD9O15198 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD9O15198 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD9O15198 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD9O15198 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD9O15198 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD9O15198 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD9O15198 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD9O15198 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD9O15198 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD9O15198 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD9O15198 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD9O15198 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD9O15198 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD9O15198 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD9O15198 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD9O15198 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD9O15198 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD9O15198 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD9O15198 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD9O15198 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD9O15198 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD9O15198 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD9O15198 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD9O15198 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD9O15198 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD9O15198 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD9O15198 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD9O15198 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD9O15198 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD9O15198 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD9O15198 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD9O15198 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD9O15198 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD9O15198 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD9O15198 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD9O15198 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD9O15198 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD9O15198 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD9O15198 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD9O15198 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD9O15198 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD9O15198 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD9O15198 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD9O15198 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD9O15198 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD9O15198 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD9O15198 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD9O15198 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD9O15198 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD9O15198 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD9O15198 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD9O15198 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD9O15198 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD9O15198 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD9O15198 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD9O15198 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms