Protein–RNA interactions for Protein: A0A599

TCRBV5S2, T-cell receptor beta variable 5-6 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S2A0A599 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV5S2A0A599 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCRBV5S2A0A599 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCRBV5S2A0A599 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCRBV5S2A0A599 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCRBV5S2A0A599 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCRBV5S2A0A599 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCRBV5S2A0A599 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCRBV5S2A0A599 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCRBV5S2A0A599 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCRBV5S2A0A599 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCRBV5S2A0A599 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCRBV5S2A0A599 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCRBV5S2A0A599 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCRBV5S2A0A599 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCRBV5S2A0A599 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCRBV5S2A0A599 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TCRBV5S2A0A599 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCRBV5S2A0A599 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCRBV5S2A0A599 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCRBV5S2A0A599 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCRBV5S2A0A599 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCRBV5S2A0A599 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TCRBV5S2A0A599 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCRBV5S2A0A599 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCRBV5S2A0A599 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCRBV5S2A0A599 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCRBV5S2A0A599 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCRBV5S2A0A599 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCRBV5S2A0A599 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TCRBV5S2A0A599 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCRBV5S2A0A599 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCRBV5S2A0A599 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCRBV5S2A0A599 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCRBV5S2A0A599 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCRBV5S2A0A599 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCRBV5S2A0A599 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCRBV5S2A0A599 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCRBV5S2A0A599 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TCRBV5S2A0A599 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCRBV5S2A0A599 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCRBV5S2A0A599 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCRBV5S2A0A599 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCRBV5S2A0A599 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCRBV5S2A0A599 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCRBV5S2A0A599 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCRBV5S2A0A599 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCRBV5S2A0A599 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCRBV5S2A0A599 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCRBV5S2A0A599 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCRBV5S2A0A599 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCRBV5S2A0A599 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCRBV5S2A0A599 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCRBV5S2A0A599 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCRBV5S2A0A599 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCRBV5S2A0A599 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TCRBV5S2A0A599 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCRBV5S2A0A599 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCRBV5S2A0A599 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCRBV5S2A0A599 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCRBV5S2A0A599 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCRBV5S2A0A599 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCRBV5S2A0A599 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCRBV5S2A0A599 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCRBV5S2A0A599 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCRBV5S2A0A599 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
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