Protein–RNA interactions for Protein: R4GMX3

COMMD3-BMI1, COMMD3-BMI1 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3-BMI1R4GMX3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD3-BMI1R4GMX3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD3-BMI1R4GMX3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD3-BMI1R4GMX3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD3-BMI1R4GMX3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD3-BMI1R4GMX3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD3-BMI1R4GMX3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD3-BMI1R4GMX3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD3-BMI1R4GMX3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COMMD3-BMI1R4GMX3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COMMD3-BMI1R4GMX3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COMMD3-BMI1R4GMX3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COMMD3-BMI1R4GMX3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COMMD3-BMI1R4GMX3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COMMD3-BMI1R4GMX3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COMMD3-BMI1R4GMX3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COMMD3-BMI1R4GMX3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COMMD3-BMI1R4GMX3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COMMD3-BMI1R4GMX3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COMMD3-BMI1R4GMX3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COMMD3-BMI1R4GMX3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COMMD3-BMI1R4GMX3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COMMD3-BMI1R4GMX3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COMMD3-BMI1R4GMX3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COMMD3-BMI1R4GMX3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COMMD3-BMI1R4GMX3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COMMD3-BMI1R4GMX3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COMMD3-BMI1R4GMX3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COMMD3-BMI1R4GMX3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COMMD3-BMI1R4GMX3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COMMD3-BMI1R4GMX3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COMMD3-BMI1R4GMX3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COMMD3-BMI1R4GMX3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COMMD3-BMI1R4GMX3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COMMD3-BMI1R4GMX3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COMMD3-BMI1R4GMX3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COMMD3-BMI1R4GMX3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COMMD3-BMI1R4GMX3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COMMD3-BMI1R4GMX3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COMMD3-BMI1R4GMX3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COMMD3-BMI1R4GMX3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COMMD3-BMI1R4GMX3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COMMD3-BMI1R4GMX3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COMMD3-BMI1R4GMX3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COMMD3-BMI1R4GMX3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COMMD3-BMI1R4GMX3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COMMD3-BMI1R4GMX3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COMMD3-BMI1R4GMX3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COMMD3-BMI1R4GMX3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COMMD3-BMI1R4GMX3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COMMD3-BMI1R4GMX3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COMMD3-BMI1R4GMX3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COMMD3-BMI1R4GMX3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COMMD3-BMI1R4GMX3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COMMD3-BMI1R4GMX3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COMMD3-BMI1R4GMX3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COMMD3-BMI1R4GMX3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COMMD3-BMI1R4GMX3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COMMD3-BMI1R4GMX3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COMMD3-BMI1R4GMX3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COMMD3-BMI1R4GMX3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COMMD3-BMI1R4GMX3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COMMD3-BMI1R4GMX3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COMMD3-BMI1R4GMX3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COMMD3-BMI1R4GMX3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COMMD3-BMI1R4GMX3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COMMD3-BMI1R4GMX3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COMMD3-BMI1R4GMX3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COMMD3-BMI1R4GMX3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COMMD3-BMI1R4GMX3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COMMD3-BMI1R4GMX3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COMMD3-BMI1R4GMX3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COMMD3-BMI1R4GMX3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COMMD3-BMI1R4GMX3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COMMD3-BMI1R4GMX3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COMMD3-BMI1R4GMX3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COMMD3-BMI1R4GMX3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COMMD3-BMI1R4GMX3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COMMD3-BMI1R4GMX3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COMMD3-BMI1R4GMX3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COMMD3-BMI1R4GMX3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COMMD3-BMI1R4GMX3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COMMD3-BMI1R4GMX3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COMMD3-BMI1R4GMX3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COMMD3-BMI1R4GMX3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COMMD3-BMI1R4GMX3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COMMD3-BMI1R4GMX3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COMMD3-BMI1R4GMX3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COMMD3-BMI1R4GMX3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COMMD3-BMI1R4GMX3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COMMD3-BMI1R4GMX3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COMMD3-BMI1R4GMX3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COMMD3-BMI1R4GMX3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COMMD3-BMI1R4GMX3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COMMD3-BMI1R4GMX3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COMMD3-BMI1R4GMX3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COMMD3-BMI1R4GMX3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms