Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPN7Q9Y6W3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAPN7Q9Y6W3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN7Q9Y6W3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN7Q9Y6W3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN7Q9Y6W3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN7Q9Y6W3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN7Q9Y6W3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN7Q9Y6W3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN7Q9Y6W3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN7Q9Y6W3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN7Q9Y6W3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN7Q9Y6W3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN7Q9Y6W3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN7Q9Y6W3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN7Q9Y6W3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN7Q9Y6W3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN7Q9Y6W3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN7Q9Y6W3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN7Q9Y6W3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN7Q9Y6W3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN7Q9Y6W3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN7Q9Y6W3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN7Q9Y6W3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN7Q9Y6W3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN7Q9Y6W3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN7Q9Y6W3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN7Q9Y6W3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN7Q9Y6W3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN7Q9Y6W3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN7Q9Y6W3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN7Q9Y6W3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN7Q9Y6W3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN7Q9Y6W3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN7Q9Y6W3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN7Q9Y6W3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN7Q9Y6W3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN7Q9Y6W3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN7Q9Y6W3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN7Q9Y6W3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN7Q9Y6W3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN7Q9Y6W3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN7Q9Y6W3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN7Q9Y6W3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN7Q9Y6W3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN7Q9Y6W3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN7Q9Y6W3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN7Q9Y6W3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN7Q9Y6W3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN7Q9Y6W3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN7Q9Y6W3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN7Q9Y6W3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN7Q9Y6W3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN7Q9Y6W3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN7Q9Y6W3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN7Q9Y6W3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN7Q9Y6W3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN7Q9Y6W3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN7Q9Y6W3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN7Q9Y6W3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN7Q9Y6W3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN7Q9Y6W3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN7Q9Y6W3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN7Q9Y6W3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN7Q9Y6W3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN7Q9Y6W3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN7Q9Y6W3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN7Q9Y6W3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN7Q9Y6W3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN7Q9Y6W3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN7Q9Y6W3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN7Q9Y6W3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN7Q9Y6W3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN7Q9Y6W3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN7Q9Y6W3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN7Q9Y6W3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPN7Q9Y6W3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN7Q9Y6W3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN7Q9Y6W3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN7Q9Y6W3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN7Q9Y6W3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN7Q9Y6W3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN7Q9Y6W3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN7Q9Y6W3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN7Q9Y6W3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN7Q9Y6W3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN7Q9Y6W3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN7Q9Y6W3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN7Q9Y6W3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN7Q9Y6W3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN7Q9Y6W3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN7Q9Y6W3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN7Q9Y6W3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN7Q9Y6W3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN7Q9Y6W3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN7Q9Y6W3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN7Q9Y6W3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN7Q9Y6W3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN7Q9Y6W3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAPN7Q9Y6W3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 284.9 ms