Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX6Q9UPM6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LHX6Q9UPM6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LHX6Q9UPM6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX6Q9UPM6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX6Q9UPM6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX6Q9UPM6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX6Q9UPM6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX6Q9UPM6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX6Q9UPM6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX6Q9UPM6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX6Q9UPM6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX6Q9UPM6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX6Q9UPM6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX6Q9UPM6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX6Q9UPM6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX6Q9UPM6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX6Q9UPM6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX6Q9UPM6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX6Q9UPM6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX6Q9UPM6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LHX6Q9UPM6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX6Q9UPM6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX6Q9UPM6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX6Q9UPM6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LHX6Q9UPM6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LHX6Q9UPM6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LHX6Q9UPM6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LHX6Q9UPM6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LHX6Q9UPM6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX6Q9UPM6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX6Q9UPM6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LHX6Q9UPM6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX6Q9UPM6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX6Q9UPM6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX6Q9UPM6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX6Q9UPM6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX6Q9UPM6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX6Q9UPM6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX6Q9UPM6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX6Q9UPM6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX6Q9UPM6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX6Q9UPM6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX6Q9UPM6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX6Q9UPM6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX6Q9UPM6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX6Q9UPM6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX6Q9UPM6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX6Q9UPM6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX6Q9UPM6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LHX6Q9UPM6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHX6Q9UPM6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHX6Q9UPM6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHX6Q9UPM6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHX6Q9UPM6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX6Q9UPM6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX6Q9UPM6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHX6Q9UPM6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHX6Q9UPM6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LHX6Q9UPM6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX6Q9UPM6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX6Q9UPM6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX6Q9UPM6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX6Q9UPM6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX6Q9UPM6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX6Q9UPM6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX6Q9UPM6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX6Q9UPM6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX6Q9UPM6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX6Q9UPM6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHX6Q9UPM6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LHX6Q9UPM6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LHX6Q9UPM6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX6Q9UPM6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX6Q9UPM6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX6Q9UPM6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX6Q9UPM6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX6Q9UPM6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX6Q9UPM6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX6Q9UPM6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX6Q9UPM6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX6Q9UPM6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX6Q9UPM6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX6Q9UPM6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX6Q9UPM6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX6Q9UPM6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX6Q9UPM6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX6Q9UPM6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX6Q9UPM6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX6Q9UPM6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX6Q9UPM6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX6Q9UPM6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LHX6Q9UPM6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LHX6Q9UPM6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX6Q9UPM6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX6Q9UPM6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX6Q9UPM6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX6Q9UPM6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX6Q9UPM6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX6Q9UPM6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms