Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ0

STRIP2, Striatin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP2Q9ULQ0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
STRIP2Q9ULQ0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
STRIP2Q9ULQ0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
STRIP2Q9ULQ0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
STRIP2Q9ULQ0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STRIP2Q9ULQ0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.56■■■□□ 2
STRIP2Q9ULQ0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
STRIP2Q9ULQ0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRIP2Q9ULQ0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
STRIP2Q9ULQ0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRIP2Q9ULQ0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STRIP2Q9ULQ0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
STRIP2Q9ULQ0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STRIP2Q9ULQ0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
STRIP2Q9ULQ0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
STRIP2Q9ULQ0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STRIP2Q9ULQ0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRIP2Q9ULQ0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRIP2Q9ULQ0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRIP2Q9ULQ0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRIP2Q9ULQ0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
STRIP2Q9ULQ0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
STRIP2Q9ULQ0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRIP2Q9ULQ0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRIP2Q9ULQ0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRIP2Q9ULQ0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRIP2Q9ULQ0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRIP2Q9ULQ0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRIP2Q9ULQ0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRIP2Q9ULQ0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRIP2Q9ULQ0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRIP2Q9ULQ0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
STRIP2Q9ULQ0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
STRIP2Q9ULQ0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRIP2Q9ULQ0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRIP2Q9ULQ0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRIP2Q9ULQ0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRIP2Q9ULQ0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
STRIP2Q9ULQ0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
STRIP2Q9ULQ0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
STRIP2Q9ULQ0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
STRIP2Q9ULQ0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRIP2Q9ULQ0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRIP2Q9ULQ0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRIP2Q9ULQ0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRIP2Q9ULQ0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRIP2Q9ULQ0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRIP2Q9ULQ0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRIP2Q9ULQ0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRIP2Q9ULQ0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRIP2Q9ULQ0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRIP2Q9ULQ0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
STRIP2Q9ULQ0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRIP2Q9ULQ0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRIP2Q9ULQ0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRIP2Q9ULQ0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRIP2Q9ULQ0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRIP2Q9ULQ0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRIP2Q9ULQ0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
STRIP2Q9ULQ0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRIP2Q9ULQ0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRIP2Q9ULQ0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRIP2Q9ULQ0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
STRIP2Q9ULQ0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRIP2Q9ULQ0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRIP2Q9ULQ0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRIP2Q9ULQ0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRIP2Q9ULQ0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRIP2Q9ULQ0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRIP2Q9ULQ0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRIP2Q9ULQ0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRIP2Q9ULQ0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRIP2Q9ULQ0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRIP2Q9ULQ0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
STRIP2Q9ULQ0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRIP2Q9ULQ0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
STRIP2Q9ULQ0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRIP2Q9ULQ0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRIP2Q9ULQ0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRIP2Q9ULQ0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRIP2Q9ULQ0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRIP2Q9ULQ0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRIP2Q9ULQ0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STRIP2Q9ULQ0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STRIP2Q9ULQ0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRIP2Q9ULQ0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
STRIP2Q9ULQ0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRIP2Q9ULQ0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRIP2Q9ULQ0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRIP2Q9ULQ0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRIP2Q9ULQ0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRIP2Q9ULQ0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRIP2Q9ULQ0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRIP2Q9ULQ0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRIP2Q9ULQ0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRIP2Q9ULQ0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
STRIP2Q9ULQ0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
STRIP2Q9ULQ0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
STRIP2Q9ULQ0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
STRIP2Q9ULQ0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms