Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY7

CDV3, Protein CDV3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3Q9UKY7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDV3Q9UKY7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDV3Q9UKY7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDV3Q9UKY7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDV3Q9UKY7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDV3Q9UKY7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDV3Q9UKY7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDV3Q9UKY7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDV3Q9UKY7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDV3Q9UKY7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDV3Q9UKY7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDV3Q9UKY7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDV3Q9UKY7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDV3Q9UKY7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDV3Q9UKY7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDV3Q9UKY7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDV3Q9UKY7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDV3Q9UKY7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDV3Q9UKY7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDV3Q9UKY7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDV3Q9UKY7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDV3Q9UKY7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CDV3Q9UKY7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDV3Q9UKY7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDV3Q9UKY7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDV3Q9UKY7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDV3Q9UKY7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDV3Q9UKY7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDV3Q9UKY7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDV3Q9UKY7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDV3Q9UKY7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDV3Q9UKY7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDV3Q9UKY7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDV3Q9UKY7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDV3Q9UKY7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDV3Q9UKY7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDV3Q9UKY7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDV3Q9UKY7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDV3Q9UKY7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDV3Q9UKY7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDV3Q9UKY7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDV3Q9UKY7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDV3Q9UKY7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDV3Q9UKY7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDV3Q9UKY7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDV3Q9UKY7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDV3Q9UKY7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDV3Q9UKY7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CDV3Q9UKY7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CDV3Q9UKY7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDV3Q9UKY7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDV3Q9UKY7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDV3Q9UKY7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDV3Q9UKY7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDV3Q9UKY7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CDV3Q9UKY7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDV3Q9UKY7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDV3Q9UKY7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDV3Q9UKY7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDV3Q9UKY7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDV3Q9UKY7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDV3Q9UKY7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDV3Q9UKY7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDV3Q9UKY7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDV3Q9UKY7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDV3Q9UKY7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDV3Q9UKY7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CDV3Q9UKY7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDV3Q9UKY7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDV3Q9UKY7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDV3Q9UKY7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDV3Q9UKY7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDV3Q9UKY7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDV3Q9UKY7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CDV3Q9UKY7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDV3Q9UKY7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDV3Q9UKY7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDV3Q9UKY7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDV3Q9UKY7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDV3Q9UKY7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDV3Q9UKY7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDV3Q9UKY7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDV3Q9UKY7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDV3Q9UKY7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDV3Q9UKY7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDV3Q9UKY7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDV3Q9UKY7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDV3Q9UKY7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDV3Q9UKY7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDV3Q9UKY7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDV3Q9UKY7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDV3Q9UKY7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDV3Q9UKY7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDV3Q9UKY7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDV3Q9UKY7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDV3Q9UKY7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDV3Q9UKY7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CDV3Q9UKY7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDV3Q9UKY7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDV3Q9UKY7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms