Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
STAG3Q9UJ98 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
STAG3Q9UJ98 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
STAG3Q9UJ98 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
STAG3Q9UJ98 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
STAG3Q9UJ98 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.08■■■■□ 3.69
STAG3Q9UJ98 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.68
STAG3Q9UJ98 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
STAG3Q9UJ98 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
STAG3Q9UJ98 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
STAG3Q9UJ98 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
STAG3Q9UJ98 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
STAG3Q9UJ98 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
STAG3Q9UJ98 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
STAG3Q9UJ98 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
STAG3Q9UJ98 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC38.03■■■■□ 3.68
STAG3Q9UJ98 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
STAG3Q9UJ98 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
STAG3Q9UJ98 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
STAG3Q9UJ98 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
STAG3Q9UJ98 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
STAG3Q9UJ98 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
STAG3Q9UJ98 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
STAG3Q9UJ98 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
STAG3Q9UJ98 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
STAG3Q9UJ98 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
STAG3Q9UJ98 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
STAG3Q9UJ98 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
STAG3Q9UJ98 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
STAG3Q9UJ98 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
STAG3Q9UJ98 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
STAG3Q9UJ98 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
STAG3Q9UJ98 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
STAG3Q9UJ98 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
STAG3Q9UJ98 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
STAG3Q9UJ98 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
STAG3Q9UJ98 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
STAG3Q9UJ98 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
STAG3Q9UJ98 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
STAG3Q9UJ98 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
STAG3Q9UJ98 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
STAG3Q9UJ98 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
STAG3Q9UJ98 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
STAG3Q9UJ98 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
STAG3Q9UJ98 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
STAG3Q9UJ98 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
STAG3Q9UJ98 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
STAG3Q9UJ98 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
STAG3Q9UJ98 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
STAG3Q9UJ98 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
STAG3Q9UJ98 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
STAG3Q9UJ98 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
STAG3Q9UJ98 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
STAG3Q9UJ98 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
STAG3Q9UJ98 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
STAG3Q9UJ98 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
STAG3Q9UJ98 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
STAG3Q9UJ98 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
STAG3Q9UJ98 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
STAG3Q9UJ98 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
STAG3Q9UJ98 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
STAG3Q9UJ98 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
STAG3Q9UJ98 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
STAG3Q9UJ98 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
STAG3Q9UJ98 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
STAG3Q9UJ98 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
STAG3Q9UJ98 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
STAG3Q9UJ98 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
STAG3Q9UJ98 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
STAG3Q9UJ98 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
STAG3Q9UJ98 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
STAG3Q9UJ98 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
STAG3Q9UJ98 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
STAG3Q9UJ98 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
STAG3Q9UJ98 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
STAG3Q9UJ98 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
STAG3Q9UJ98 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
STAG3Q9UJ98 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
STAG3Q9UJ98 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
STAG3Q9UJ98 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
STAG3Q9UJ98 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
STAG3Q9UJ98 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
STAG3Q9UJ98 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
STAG3Q9UJ98 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
STAG3Q9UJ98 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
STAG3Q9UJ98 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
STAG3Q9UJ98 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
STAG3Q9UJ98 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
STAG3Q9UJ98 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
STAG3Q9UJ98 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
STAG3Q9UJ98 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
STAG3Q9UJ98 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
STAG3Q9UJ98 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
STAG3Q9UJ98 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
STAG3Q9UJ98 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
STAG3Q9UJ98 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
STAG3Q9UJ98 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
STAG3Q9UJ98 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
STAG3Q9UJ98 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
STAG3Q9UJ98 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms