Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MBD1Q9UIS9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MBD1Q9UIS9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD1Q9UIS9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD1Q9UIS9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD1Q9UIS9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD1Q9UIS9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD1Q9UIS9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD1Q9UIS9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD1Q9UIS9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD1Q9UIS9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD1Q9UIS9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD1Q9UIS9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD1Q9UIS9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD1Q9UIS9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD1Q9UIS9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MBD1Q9UIS9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MBD1Q9UIS9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MBD1Q9UIS9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MBD1Q9UIS9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MBD1Q9UIS9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MBD1Q9UIS9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MBD1Q9UIS9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MBD1Q9UIS9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MBD1Q9UIS9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MBD1Q9UIS9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MBD1Q9UIS9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD1Q9UIS9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD1Q9UIS9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD1Q9UIS9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD1Q9UIS9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD1Q9UIS9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD1Q9UIS9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD1Q9UIS9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD1Q9UIS9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MBD1Q9UIS9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD1Q9UIS9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD1Q9UIS9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MBD1Q9UIS9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MBD1Q9UIS9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD1Q9UIS9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD1Q9UIS9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD1Q9UIS9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MBD1Q9UIS9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MBD1Q9UIS9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MBD1Q9UIS9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD1Q9UIS9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD1Q9UIS9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD1Q9UIS9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD1Q9UIS9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD1Q9UIS9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MBD1Q9UIS9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MBD1Q9UIS9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD1Q9UIS9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD1Q9UIS9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD1Q9UIS9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD1Q9UIS9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MBD1Q9UIS9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MBD1Q9UIS9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MBD1Q9UIS9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MBD1Q9UIS9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MBD1Q9UIS9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MBD1Q9UIS9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MBD1Q9UIS9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MBD1Q9UIS9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MBD1Q9UIS9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MBD1Q9UIS9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MBD1Q9UIS9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms