Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMTOR3Q9UHA4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMTOR3Q9UHA4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMTOR3Q9UHA4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMTOR3Q9UHA4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMTOR3Q9UHA4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMTOR3Q9UHA4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMTOR3Q9UHA4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMTOR3Q9UHA4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMTOR3Q9UHA4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMTOR3Q9UHA4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMTOR3Q9UHA4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMTOR3Q9UHA4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMTOR3Q9UHA4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms