Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.51■■■■■ 4.24
KDM5BQ9UGL1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
KDM5BQ9UGL1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.23
KDM5BQ9UGL1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
KDM5BQ9UGL1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
KDM5BQ9UGL1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
KDM5BQ9UGL1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
KDM5BQ9UGL1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
KDM5BQ9UGL1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
KDM5BQ9UGL1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
KDM5BQ9UGL1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
KDM5BQ9UGL1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
KDM5BQ9UGL1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
KDM5BQ9UGL1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
KDM5BQ9UGL1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
KDM5BQ9UGL1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
KDM5BQ9UGL1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
KDM5BQ9UGL1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.23
KDM5BQ9UGL1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.23
KDM5BQ9UGL1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.23
KDM5BQ9UGL1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
KDM5BQ9UGL1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
KDM5BQ9UGL1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
KDM5BQ9UGL1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
KDM5BQ9UGL1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
KDM5BQ9UGL1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
KDM5BQ9UGL1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
KDM5BQ9UGL1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
KDM5BQ9UGL1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC41.38■■■■■ 4.21
KDM5BQ9UGL1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
KDM5BQ9UGL1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
KDM5BQ9UGL1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
KDM5BQ9UGL1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
KDM5BQ9UGL1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
KDM5BQ9UGL1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
KDM5BQ9UGL1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
KDM5BQ9UGL1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
KDM5BQ9UGL1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
KDM5BQ9UGL1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
KDM5BQ9UGL1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
KDM5BQ9UGL1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
KDM5BQ9UGL1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
KDM5BQ9UGL1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
KDM5BQ9UGL1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
KDM5BQ9UGL1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
KDM5BQ9UGL1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
KDM5BQ9UGL1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
KDM5BQ9UGL1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
KDM5BQ9UGL1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
KDM5BQ9UGL1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
KDM5BQ9UGL1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
KDM5BQ9UGL1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
KDM5BQ9UGL1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
KDM5BQ9UGL1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
KDM5BQ9UGL1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
KDM5BQ9UGL1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
KDM5BQ9UGL1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
KDM5BQ9UGL1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
KDM5BQ9UGL1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
KDM5BQ9UGL1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
KDM5BQ9UGL1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
KDM5BQ9UGL1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC41.18■■■■■ 4.18
KDM5BQ9UGL1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
KDM5BQ9UGL1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
KDM5BQ9UGL1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
KDM5BQ9UGL1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
KDM5BQ9UGL1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
KDM5BQ9UGL1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
KDM5BQ9UGL1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
KDM5BQ9UGL1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
KDM5BQ9UGL1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
KDM5BQ9UGL1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
KDM5BQ9UGL1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
KDM5BQ9UGL1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC41.13■■■■■ 4.18
KDM5BQ9UGL1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
KDM5BQ9UGL1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
KDM5BQ9UGL1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
KDM5BQ9UGL1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
KDM5BQ9UGL1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
KDM5BQ9UGL1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
KDM5BQ9UGL1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
KDM5BQ9UGL1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
KDM5BQ9UGL1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
KDM5BQ9UGL1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
KDM5BQ9UGL1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
KDM5BQ9UGL1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
KDM5BQ9UGL1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
KDM5BQ9UGL1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
KDM5BQ9UGL1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
KDM5BQ9UGL1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.16
KDM5BQ9UGL1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
KDM5BQ9UGL1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
KDM5BQ9UGL1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
KDM5BQ9UGL1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
KDM5BQ9UGL1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
KDM5BQ9UGL1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
KDM5BQ9UGL1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
KDM5BQ9UGL1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
KDM5BQ9UGL1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms