Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEF1Q9UBV8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEF1Q9UBV8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEF1Q9UBV8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEF1Q9UBV8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEF1Q9UBV8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEF1Q9UBV8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PEF1Q9UBV8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PEF1Q9UBV8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PEF1Q9UBV8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PEF1Q9UBV8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEF1Q9UBV8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEF1Q9UBV8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEF1Q9UBV8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEF1Q9UBV8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEF1Q9UBV8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEF1Q9UBV8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEF1Q9UBV8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PEF1Q9UBV8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEF1Q9UBV8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEF1Q9UBV8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEF1Q9UBV8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEF1Q9UBV8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEF1Q9UBV8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEF1Q9UBV8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEF1Q9UBV8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEF1Q9UBV8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEF1Q9UBV8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEF1Q9UBV8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEF1Q9UBV8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PEF1Q9UBV8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEF1Q9UBV8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEF1Q9UBV8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEF1Q9UBV8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms